Вот это очень плохо, вот прям очень. Не нужно прокидывать tpl с фронта, его нужно задавать строго на сервере.

Объекты тут вообще не нужны

неплохо хотя бы поверхностно обработать

$query = strip_tags($_POST['query']); // хватит?

Можно добавить (int).

if($_POST['minQuery'] && is_numeric($_POST['minQuery'])){
    $minQuery = (int)$_POST['minQuery'];
}
else{
    $minQuery = 3;
}

document.querySelector('.jsSearchForm').addEventListener(event, function (e) {
     e.preventDefault();
     let formData = new FormData(e.target.closest('form'));
     sendAjax(formData);
});

<input type="hidden" name="tpl" value="@FILE chunks/blocks/service-item.html">

$resources = $modx->getIterator('msProduct',$dbQuery);

$dbQuery->select(['id']);
if ($dbQuery->prepare() && $dbQuery->stmt->execute()) {
    $ids = $dbQuery->stmt->fetchAll(PDO::FETCH_COLUMN);
}

$minQuery = $_POST['minQuery'] ?: 3;

Fatal error: Uncaught Exception: String could not be parsed as XML in

{$_modx->runSnippet('pdoResources', [
	'parents' => 2,
	'depth' => 1,
	'limit' => 0,
	'fastMode' => 1,
	'select' => 'id,pagetitle,menutitle,uri,parent',
	'where' => '{"class_key": "msCategory"}',
	'sortby' => 'pagetitle',
'sortdir' => 'asc',
'limit' => 0,
	'tpl' => '@INLINE <li class="bg-none"><a rel="nofollow" href="{$uri}">{if $menutitle}{$menutitle}{else}{$pagetitle}{/if}</a></li>'
])}