Роман

Стоит ли копаться и решать проблему или лучше откатить Minishop2 до 2.5.0-pl?

Т.к. вводных данных крайне мало, можно только теоретизировать:

Для начала стоит посмотреть логи, как MODX так и серверные. Сбой отправки на почту с обновлением вряд ли связан, и имеет другие причины, это уже надо посмотреть логи и что там происходит при отправке.

С CRM вероятно чуть сложнее, зависит от того, использовался какой либо готовый доп из модстора или самопис, но в любом случае это поправимо.

Имхо, лучше поправить ошибки, и остаться на актуальных версиях дополнений.

Можно так:

<?php
$id = $modx->resource->id;
$tpl = '@INLINE <li><a href="[[~[[+id]]]]">[[#[[+id]].tvname]]</a></li>'; // tvname - имя Вашей TV
//.....

Зачем это через mFilter2 делать? Мерчант-центр будет на фильтры нажимать, или что?

[[!msProducts?
    &parents=`69,70,323,760,819,846,820`
    &resources=`-1052,-1053,-1054`
    &depth=`100`
    &limit=`0`
    &tplOuter=`mFilter2OuterTplXML`
    &tpl=`tpl.msProducts.row.Roman.XML`
]]

Вы не поняли подсказку

[[!mSearch2?
&returnIds=`1`
&limit=`0`
&toPlaceholder=`result`
]]

[[+result:isnot=``:then=`
[[!pdoPage?
    &element=`msProducts`
    &parents=`0`
    &resources=`[[+result]]`
    &sortby=`{"Data.popular":"DESC"}`
    &tpl=`tpl.mSearch2.row.Roman`
]]
`:else=`Я подсказка. Ничего не могу найти, не знаю что делать...`]]

Изучайте документацию MODX, а точнее phx фильтры или переходите на шаблонизаторы

Это код на Fenom — Шаблонизатор Fenom.

Для того чтобы работал код, должен быть установлен pdoTools и включена системная настройка — Использовать Fenom на страницах.

На стандартном парсере будет как то так:

[[!#GET.page:is=``:then=`[[*introtext]]`:else=``]]

Можно на простых ресурсах.
Категории, к которым привязывать — просто через TV с типом «Множественный выбор».
Возможные значения формировать таким образом, чтобы при отметке получались ID через какой-нибудь разделитель.

Например, у категорий шаблон с ID = 5. В возможных значениях у TV пишете:

@EVAL return $modx->runSnippet('pdoResources',array(
'parents'=>15, // ID родителя категорий
'templates' => 5,
'limit'=>0,
'sortby'=>'{"pagetitle":"ASC"}',
'tpl'=>'@INLINE [[+pagetitle]]==#[[+id]]#',
'outputSeparator'=>'||'
));

Называете эту TV categories. У ресурсов выбираете, где выводить.

Вывод же в самой категории через tvFilters:

[[pdoResources?
&tvFilters=`categories==%#[[*id]]#%`
.....
]]

А комменты можете через TicketsComments к любому ресурсу прикрутить.

Используйте miniShop2, в нем есть функция мультикатегорий категорий. + удобно добавлять поля + галерея есть встроенная.

У вас в файле assets/app/js/libs.js подключается jquery 1.11.2, который перекрывает остальные, и поэтому не работает. Скорее всего из-за этого

Приведу пример через сниппет (самый удобный вариант):

Пишем сниппет sendRedirect:

<?php
	$id = intval($id);
	if ($modx->getCount('modResource', array('id' => $id))) {
		$modx->sendRedirect($modx->makeUrl($id), array('responseCode' => 'HTTP/1.1 301 Moved Permanently'));
	}
	else {
		return;
	}

И вызываем его в чанке tpl.msOrder.success

[[!sendRedirect? &id=`айди_страницы`]]

&sortby=`{"Data.price":"ASC","Data.popular":"DESC"}`

так не подходит?